Na prvního června 2016 stanovila společnost Microsoft zahájení komerčního prodeje databázového systému SQL Server 2016. Podobně jako u předchozí verze 2014 se v nabídce objeví bezplatné varianty Developer a Express. Pro podnikové nasazení budou k dispozici vydání Enterprise a Standard.
Vedle vydání on-premise varianty SQL Serveru 2016 se standardní instalací na server připraví společnost Microsoft od června také virtuální instance v prostředí cloudové platformy Azure. Některé funkce z nejnovější verze, například Strech Database nebo Always Encrypted, sice již nabízí služba Azure SQL Database, ale stále existuje mnoho zákazníků, kteří preferují vlastní správu databázové infrastruktury. Případně chtějí virtuální instance použít na testování aplikací před přechodem na on-premise variantu SQL Serveru 2016.
Zmíněná funkce Stretch Database umožňuje ukládat některá data v cloudovém prostředí Azure. Obvykle jde o ta s nižší frekvencí využití. Aplikace, která s databází pracuje, ale stále „vidí“, resp. má stálý přístup k veškerému jejímu obsahu bez ohledu na místo uložení. Funkce Always Encrypted nabízí šifrování dat na úrovni sloupců databáze. Nastavení lze upravovat jak v klidovém režimu, tak v paměti. Další funkcionality verze 2016 podporují mobilní business intelligence nebo aplikace tzv. velkých dat.